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神秘集團：「Humarise」計畫要殲滅世界上所有擁有「個性」的人類，為了拯救人們，全世界各地的英雄集結起來、組成了「世界英雄選拔隊」。以在進行實習的綠谷、爆豪跟轟為首，雄英高中英雄科的學生們也加入成為隊員，跟著職業英雄們一起面對這場世界性的重大危機。 隨著人類滅亡的倒數時間一步步逼近，他們能否守護這個世界的未來…？...

千葉敦子是一家精神醫療中心的年輕女醫生，她一直致力於最尖端的精神醫療技術與臨床應用的研究，她和天才科學家時田浩作一起發明了一種能監測病患夢境、可以窺視人們心中與腦袋瓜裡秘密的儀器「DC MINI」，除了監控夢境，這個儀器更可以改變病患的夢境，在精神治療方面相當有效；不料，這個儀器突然被盜走，接著，這項研究的相關人員相繼在夢中遭到不測。敦子為此展開了調查，但也遭到暗算；然而，敦子可不是普通人物，她擁有另一個身分——「盜夢偵探紅辣椒」。 紅辣椒具有同步體驗他人夢境的特殊能力，曾多次成功治愈患者的心...

真新鎮的小智以成為寶可夢大師為目標，但他啟程的第一天卻睡過了頭，使他沒能拿到三個初學者寶可夢（妙蛙種子、傑尼龜、小火龍）中的任何一個，而是得到一隻不願意進入寶貝球的皮卡丘。儘管小智很希望與皮卡丘成為朋友，但皮卡丘不領情，不斷以電擊攻擊小智，他的某次攻擊意外命中了烈雀，憤怒的烈雀群起追擊小智與皮卡丘，小智希望皮卡丘進入球中以免受傷害，而受傷的皮卡丘看到小智保護自己的背影，決定成為小智的夥伴。就在此時，傳說的寶可夢鳳王飛過現出彩虹的天空，留下一根彩虹羽毛給小智。...

世界最大的體育盛會「WSG -World Sports Games-」暌違多年將在東京舉辦。日本為盛大舉行開幕儀式，展現日本最尖端技術──世界首創最高時速1000km的「真空超電導新幹線」，在新名古屋站和東京之間開通！在世人目光的注視下，知名大會贊助商匯集的會場中，各大企業老闆光天化日下相繼被綁架。此時，卻發現赤井秀一竟在背地監視，並指揮FBI成員們的行動。同時，柯南想起15年前在美國波士頓發生的驚悚WSG連續綁架事件也是由FBI負責偵查，或許這一場事件，敵人就是自己人，然而各種證據顯示出的不在...

故事以亞絲娜的視角深入〈艾恩葛朗特〉篇，描繪了新手亞絲娜成為「閃光」的成長過程。該作還有新角色米特在亞絲娜與桐人組隊前登場。 此作為河野亞矢子執導的首部劇場版動畫，她強調劇場版製作旨在讓觀眾觀後還想看電視動畫。因此，雖然該作有接近電視動畫〈艾恩葛朗特〉篇第一季第一話和第二話的剪輯和細節，但不斷有新的設計、效果，與後續劇情發展相關的角色在外觀等方面也在發生無處不在的變化。...

兩年前，10歲的天才少年澤田弘樹在完成人工智慧後墜樓身亡。兩年後的某一天，眾多政商名流來到米花市政大樓。這裡正在舉行能夠一舉改變全世界遊戲業界價值觀的模擬遊戲機「繭」的發表會。他們的子女全都受邀參加。玩家可透過這個遊戲，進入虛擬世界中，體驗實地遊玩遊戲的快感。結合最先進技術的「繭」，其遊戲方式是先進入一部外型酷似蠶繭的大型膠囊，透過電腦操作讓遊戲者沉睡於歷史上曾經發生過事件的年代，並進行挑戰的虛擬體驗遊戲。 柯南、灰原及少年偵探團成員們也接獲邀請，前往參加這場受到全世界矚目的發表會，並陰錯陽差...

正當東京街頭充滿萬聖節氛圍時，澀谷 HIKARIE 正在舉行婚禮，而婚禮現場有著身穿禮服的佐藤刑警。正當柯南一行人在現場觀察著來賓時，現場突然闖進了一名暴徒，而為了保護大家的高木刑警卻因此身陷危機？！雖然後來事件安全落幕，但佐藤卻回想起了 3 年前的連續爆炸案件，而當時殉職的松田刑警恰巧與高木刑警的身影重疊。 與此同時，連續爆炸案件的犯人逃獄了，究竟這一連串的事件純粹是巧合還是另有隱情？公安警察的降谷零 (安室透) 為了前往追捕逃獄的犯人，卻被神秘的偽裝男子戴上了頸圈炸彈。為了將炸彈解除而潛伏...

以635米的高度為傲、可以俯瞰東京街景的鈴木塔（Bell Tree Tower）竣工。前往參加其開幕儀式的柯南等人，從眺望台上享受著絕美的景色。就在此時，一發子彈擊碎了窗戶玻璃，打穿了一個男人的胸膛。案件發生於一瞬之間，完全搞不清到底發生了什麼，小蘭與少年偵探團陷入恐慌。柯南立刻利用追蹤眼鏡的望遠鏡功能，沿著彈道發現了一個黑色的身影。「從那麼遠的距離進行狙擊，怎麼可能？！」柯南馬上與女高中生偵探世良真純乘坐摩托車追趕逃走的狙擊手，意想不到的是狙擊手居然連警察的巡邏車都打算一起炸掉，整個追蹤過程都...

傳說中創造世界的神奇寶貝阿爾宙斯，在某次災難中拯救了世界不被滅亡，但卻身受重傷，是達摩斯救了他。 之後，為了使米季納的土地復甦，阿爾宙斯將其生命寶玉借給達摩斯，並約定在下一個日蝕之日歸還，但達摩斯卻背叛了誓言。 阿爾宙斯長眠前，許下「當我下一次醒來後將對人類進行制裁」的誓言。 在阿爾宙斯甦醒之後，以壓倒性的力量將三神徹底打敗，而帝牙盧卡也在倒下前夕將小智一行人送到過去，去了解達摩斯為什麼會背叛阿爾宙斯的真正緣由。...

以第二部曲《福音戰士新劇場版：破》14年後為故事背景，明日香所駕駛的巨大類人型戰鬥機器人EVA3號機大暴走，並且被初號機擊毀後生死未卜。碇真嗣在戰鬥中使初號機完全覺醒，初號機頭上出現的天使光環，暗示人類將遭遇更可怕的第三次衝擊，第三新東京市亦發生前所未有的巨變。已40多歲的葛城美里（三石琴乃配音）為此帶領原屬特務機關NERV的部份人員，脫離「NERV」，並成立新組織「Wille」與之對抗，對所有隸屬NERV的EVA展開殲滅行動，葛城美里授命復活的明日香（宮村優子配音）和真裡（阪本真綾配音）奪回被...

朝倉市長收到一封神秘的恐嚇信，內容為：「對於你那4年執政中桀驁不馴的態度，上天將給予懲罰！」。隔天，由市長主導開通的新地下鐵隧道遭到炸毀。雖然多虧柯南知道恐嚇信而使得這次爆破事件沒有人員傷亡，但是奪取市長性命失敗的犯人勢必將再次犯案，並帶來更大的災害，調查朝倉市長歷年事政的柯南，察覺到極有可能是在國土交通大臣時代所推動的水庫建設案中，懷有恨意的犯人就在那相關關係人等之中，因此決定進行深度搜查。 因為水庫的建造，沉入湖底的新潟縣北之澤村村民遷移到鄰近土地已有5年了，在這5周年紀念的日子裡聚集了許...

專針對警察的連續殺人案件發生了，警察內部引起巨大的回響。對於想得到案件情報的小五郎，目暮警部卻意外地守口如瓶。看到如此情況的柯南，聯想到事情可能和警察內部有莫大的關係。然後，下一個被槍擊的目標居然是佐藤刑警，剛巧在案發現場出現的小蘭受到案件的刺激而被弄至失憶。犯人為了殺人滅口，於是企圖把唯一的目擊證人殺害。深知情況嚴重的柯南，為了保護小蘭，不惜孤身犯險去把犯人找出來。...

一百年前，沙漠城市「荒漠市」因寶可夢們的對戰而蒙受極大損害，這場對戰的開端，則源自某隻寶可夢的存在。然而這隻寶可夢遭到某個人封印，如今荒漠市已恢復以往的寧靜。 小智與皮卡丘等人在旅行途中，遇見擁有「能從光環拿出所有物品」能力的幻之寶可夢—胡帕，以及照顧牠的少女「梅雅利」。愛搗蛋的胡帕，以從那個神奇光環中拿出牠最愛的甜甜圈，還有各種物品來嚇人為樂。喜歡搗蛋又天真無邪的胡帕，還稱呼小智和皮卡丘為「小知/サト」跟「皮卡/比卡」，徹底成為好朋友的胡帕和小智等人，決定一起去旅行。 抵達荒漠市時的小智一...

柯南和少年偵探團在參觀一座西多摩市新建的雙塔摩天大樓時，意外的發現了黑暗組織成員琴酒（Gin）。隨後又發生了殺人事件。殺人事件還在繼續，共同點是每名死者身邊都會留下一個小的酒杯。就在柯南和少年偵探團尋找兇手的時候，琴酒也得知他正在尋找的叛徒雪莉將在不久之後參加西多摩雙子大樓的落成典禮，並準備在典禮上將她刺殺。在典禮會場上，短暫的黑暗之後又有一人被害。現場也留下了小酒杯，顯示兇手和之前的為同一人。就在警方和毛利小五郎調查案件的時候，琴酒引爆了藏在大樓內的炸藥，銷毀了組織的情報，同時將樓頂的柯南一行...

在遠離人煙的叢林深處，有著閒雜人等禁止進入、規矩森嚴的寶可夢樂園。在這座歐可亞森林裡，住著幻之寶可夢「薩戮德」，以及被其當作寶可夢養大的少年「可可」。對於自己是寶可夢這件事深信不疑的可可，某一天遇到了小智和皮卡丘，第一次交到了「人類朋友」。自己究竟是寶可夢？還是人類？當森林的危機逼近時，寶可夢與人類之間的親子之情將受到考驗。 描述在遠離人煙的叢林深處，有著閒雜人等禁止進入、規矩森嚴的寶可夢樂園。在這座歐可亞森林裡，住著幻之寶可夢「薩戮德」，以及被其當作寶可夢養大的少年「可可」。對於自己是寶可夢...

小智一行人在旅行途中突然遇到「夢幻神奇寶貝」-波爾凱尼恩從天而降，其落下的衝撃讓小智與波爾凱尼恩被奇妙的裝置聯繫在一起，被波爾凱尼恩給牽著走的小智等人來到了有巨大齒輪的都市阿佐特王國… 擁有不停轉動的巨大齒輪的超級機關城市——阿佐特王國的大臣賈維斯，得到了他長年所追尋的終極發明。那就是500年前誕生於阿佐特王國的人造神奇寶貝——瑪機雅娜，以及據說寄存在瑪機雅娜體內，被稱為「魂心」的未知力量。 究竟被綁在一起的小智和波爾凱尼恩，能不能合力救出瑪機雅娜呢？然而，隱藏於「魂心」中的真正力量又是什麼...

梵谷名畫《向日葵》被發現，並將在紐約拍賣，然而在《向日葵》的發現地卻發生了殺人事件。在紐約拍賣會現場，全世界的大富豪匯集一堂，競拍《向日葵》。鈴木次郎吉以遠高於他人出價的3億美金將此畫拍下，他的目的是集齊散落在世界各地的7幅《向日葵》，以此能在日本舉辦史無前例的大規模展會。這則夢幻大新聞向全世界播出，柯南與灰原也津津有味的看著轉播。當正要徵集專門保護《向日葵》的護衛隊「七大武士」的時候，怪盜基德突然出現，留下了「一定會將此畫奪走」的宣戰預告。明明只偷大型寶石的基德為什麼會對名畫下手？就在此時，在...

舞臺：大阪&京都，正在錄製"皐月杯"百人一首記者會的大阪地標·日賣電視臺突然發生爆炸，千鈞一髮之際，急忙趕來的柯南救出了被困在崩塌大樓中的平次與和葉，而另一側，"皐月杯"冠軍在京都屋內遭人殺害，監控器裡所顯示出的是—紅葉...原作中的重要角色，百人一首高中生冠軍，自稱"平次未婚妻"的大岡紅葉，將首次在劇場版中登場，新一和小蘭的關係也將發生變化.......

怪盜基德再度發出預告信，目標是俄羅斯羅曼諾夫王朝的皇室秘寶「回憶之卵」。柯南與服部聯合保護「回憶之卵」，但把作案時間推理錯誤令基德得逞，但基德於逃走中途被狙擊。自此引出一連串疑問，柯南將解開一連串事件。...

柯南、小蘭、毛利小五郎以及少年偵探團等人，一同參加了神盾艦的體驗航海活動，在日本海上自衛隊員的示範下，親眼見識到氣勢非凡的空中對戰演習。這時候，神祕的敵軍突然來襲，演習旋即變成了真實的激烈對戰!小蘭與少年偵探團成員看到眼前的這一切，感到十分恐懼與不安。在海上自衛隊冷靜的應對處理下，戰況總算平息了下來，但是卻摸不清敵人的目的為何。在此同時，艦裏發現了一隻自衛隊員的左手殘肢，那隻手上戴了一隻時間停滯在上午5時30分的手錶……在如此不尋常的事態下，大阪府警方與京都府警方也緊急出動直升機前來現場，協力展...